Выпустили письмо с разъяснениями (https://clck.ru/3AsaGt) о том, как
восстановить НДС с перечисленной продавцу предоплаты
Если покупатель заявляет к вычету с перечисленной продавцу предоплаты НДС,
то налог восстанавливается в том налоговом периоде, в котором суммы НДС по
приобретенным товарам подлежат вычету. То есть это происходит после их
принятия на учет при наличии счетов-фактур и первичных документов.
На практике возникают ситуации, когда продавец произвел отгрузку товаров в
одном налоговом периоде, а покупатель принял их на учет в другом. При этом
обязанность последнего восстановить НДС возникает в период принятия товаров
на учет и не зависит от того, когда продавец отгрузил товар.
Например, в первом квартале покупатель перечислил продавцу предоплату в
счет предстоящей поставки товаров и принял к вычету НДС, предъявленный
последним по этой сумме. Товары отгружены продавцом во втором квартале, а
приняты к учету покупателем – в третьем. НДС восстанавливаются покупателем в
третьем квартале.